但引起牙周疾病一个重要的原因是忽视口腔卫生，导致牙周链球菌、乳酸杆菌等厌氧菌感染。
而酸奶类饮品种类繁多，它们共同的特点都含有乳酸菌。当饮用较多又不及时漱口，就可能会导致龋齿的产生，这是因为酸奶里的乳酸杆菌，易与唾液中的黏蛋白和食物残屑混合在一起，牢固地粘附在牙齿表面和窝沟中时，形成菌斑，极容易造成牙齿釉质表面脱钙、溶解，形成龋齿。而且牙齿对酸的耐受程度不高，当口腔内PH值较高时，也易腐蚀牙齿表面釉质，造成牙齿脱钙，最终形成龋齿。
所以，对青少年，尤其是儿童，饮用酸奶和碳酸饮料切忌过量，每次最好不要超过两盒。最重要的是，应养成良好的生活习惯，每次喝过酸奶后，一定要用清水漱口，有的人喜欢用饮料漱口，这是不科学的。
酸奶对防治牙周疾病可能有一定的益处，但是尚未见其相关详细的文献报道及作用机理。所以，目前医学界专家仍认为牙齿需防酸，如果酸奶饮用过量，反而导致龋齿的产生，这样也得不偿失。